L’UAQ est rattachée au Recteur. Elle est dirigée par un Coordinateur désigné par le Recteur. Celui-ci est secondé par une Équipe de Pilotage Opérationnel Assurance Qualité (EPO-AQ), responsable de l'élaboration, de l'exécution et du suivi des différentes tâches et services fournis par l'UAQ. Cette Equipe comprend le Coordinateur de l’UAQ, un Expert qualité, le Secrétaire général de l'Université, le Délégué du Recteur à la Pédagogie universitaire, le Responsable de l'Assurance qualité du Campus de Dubaï, un Chef de projets et 2 à 4 membres des différents campus du Liban désignés par le Recteur en consultation avec le Coordinateur de l’UAQ.
Un Centre de collecte et d’analyse de données (CCAD) est rattaché à l’UAQ. Sa mission est d’assurer les données et analyses statistiques institutionnelles officielles pour soutenir les processus d’évaluation, de prise de décision et de planification institutionnelles.
