L'ISSP vise à développer et à transmettre les connaissances nécessaires à la compréhension des problématiques de santé publique et à la mise en place d'interventions adéquates qui permettent de développer et d'améliorer l'état de santé des populations sur le plan national et régional. Il tend à devenir un Institut de référence et d'excellence en Santé Publique.
L'Institut supérieur de santé publique, vise à former les futurs leaders, agents de changements en santé publique, capables d’améliorer l’état de santé des populations et des communautés et à promouvoir l’équité en santé à travers l’innovation et l’excellence dans l’éducation interdisciplinaire, la recherche, l’expertise, le service et l’engagement communautaire