La mission de la Faculté des sciences de l’Université Saint-Joseph se résume comme suit :
 

• Appliquer la charte et les statuts de l’Université Saint-Joseph.
   
• Développer une recherche vivante dans les domaines appliqués.
   
• Former des professeurs pour l’enseignement scientifique francophone complémentaire, secondaire et universitaire.
   
• Dispenser une formation initiale et continue en mathématiques, physique, chimie, et sciences de la vie et de la terre - biochimie.
   
• Répondre aux nouvelles exigences des besoins du marché
   
• Devenir la plate-forme scientifique nationale.