La mission de la Chaire consiste à :

1. Conserver et promouvoir les archives du Fonds Youakim Moubarac. 
2. Valoriser son œuvre centrée sur le dialogue inter-religieux et la paix.
3. Poursuivre et approfondir ses travaux sur l’Église maronite et son héritage théologique, le Liban et la Palestine.
4. Lancer des programmes de recherche et des activités scientifiques qui s’inscriront dans les maintes contributions de l’USJ à la construction du savoir et au transfert des connaissances.
5. Offrir une plateforme interdisciplinaire pour réunir chercheurs et spécialistes.
6. Soutenir les travaux académiques par des bourses doctorales et des publications.
7. Transmettre l’héritage de l’Abbé Youakim Moubarac à travers des projets de sensibilisation ciblant divers publics.