فتُتح متحف ما قبل التاريخ اللبنانيّ في العام 2000 لمناسبة مرور 125 عامًا على تأسيس جامعة القدّيس يوسف، وهو تتويج لمشروع شامل بالتعاون مع معهد ما قبل التاريخ الشرقيّ الفرنسيّ ومتحف اللوفر.