Microbiote intestinal et entérocolite ulcéro-nécrosante du nouveau-né prématuré

Description :

À la naissance, le nouveau-né né à terme, jusqu’alors évoluant dans un environnement aseptique, acquiert un microbiote intestinal composé en premier de bactéries anaérobies facultatives – entérobactéries, staphylocoques, entérocoques –, puis de bactéries anaérobies strictes – Bacteroides, Clostridium, Bifidobacterium. La colonisation intestinale du nouveau-né prématuré a été beaucoup moins étudiée que celle du nouveau-né à terme. Les premières études montrent un retard d’implantation conduisant chez le grand prématuré à l’établissement d’un microbiote aberrant qui représente un facteur de risque de l’ECUN. Certaines études ont révélé que le genre Clostridium semblait particulièrement important dans cette physiopathologie sans apporter de conclusion définitive. Notre projet de recherche porte sur l’analyse microbiologique du contenu digestif de 100 nouveau-nés prématurés afin de déterminer la composition du microbiote intestinal et d’évaluer les facteurs périnataux ayant un impact sur ce microbiote. Les selles seront prélevées une fois par semaine au cours du 1er mois de vie (J7, J14, J28, ± 2 jours) des prématurés et des prélèvements maternels (prélèvements vaginaux et prélèvements de lait maternel) seront réalisés durant l’accouchement. Les analyses microbiologiques des prélèvements de selles, vaginaux et de lait seront analysés (1) par qPCR et (2) par TTGE. La qPCR permettra de mettre en évidence les principaux groupes bactériens et la TTGE permettra d’évaluer la biodiversité bactérienne. Les microbiotes des prématurés souffrant d’ECUN seront comparés à ceux des prématurés n’ayant pas de pathologies digestives dans une tentative de détermination d’un profil microbien spécifique associé à l’ECUN. Parce que la colonisation bactérienne du tube digestif peut-être centre-dépendant, les profils microbiologiques des prématurés libanais seront comparés aux profils des prématurés français et les pratiques périnatales seront analysées et comparées aux pratiques françaises pour établir des corrélations.