فـي أيلـول 2007 ، دشّـن معهـد الدراسـات الإسـلاميّة والمسـيحيّة برنامـج "الماسـتر فـي العلاقـات للإسـلاميّة والمسـيحيّة"، باللغـة العربيّـة. وفـي أيلـول 2011 ، افتتـح المعهـد برنامجًـا مماثلًا باللغـة الفرنسيّة. مـن حيـث منهجـه الأكاديمـي، يسـعى هـذا البرنامـج إلـى المسـاهمة فـي إرسـاء أسـس الحـوار بيـن الأديـان، وفـي تحقيـق السـلام المدنـيّ وتوطيـد أواصـر العيـش المشـترك الثقافـيّ والدينـيّ بيـن الأفـراد والمجتمعـات، خاصـة فـي لبنـان والشـرق الأوسـط
يهــدف الماســتر إلــى تنشــئة كــوادر فاعلــة فــي مختلــف مجــالات العلاقــات الإســلاميّة-المســيحيّة، بغيــة تعزيــز الإدارة الديموقراطيــّة للتعدّديّــة الدينيّــة والثقافيّــة فــي لبنــان وفــي المجتمعــات المماثلــة. كمــا وإنّـه يســعى إلــى تنشــئة الطــلاب علــى منهجيــات المقارنــة ومقاربــة الواقــع بانفتــاح وروح نقديّــة. تُعتمــد فــي هــذا الماســتر منهجيّــات تطبيقيّـة فــي سـبيل ترجمـة المعرفـة ثقافـةً وقـدراتٍ وسـلوكًا يتكيّــف مــع الحــالات والوقائــع المتشــعّبة
مــن الإختبــارات الإنســانية العميقــة التــي طبعــت حياتــي ومســيرتي الأكاديميّـة، هــي الماســتر فــي العلاقــات الإســلاميّة المســيحيّة. يكمــن هــذا العمــق فــي النظــرة الشــاملة والمفصّلــة لعلــم اللاهــوت فــي كلّ جوانبـه التـي تعطـي فسـحة وافـرة للنقـد والبحـث الأكاديمـيّ مـن جهـة، واحتـكاكٍ فكـريّ وإنسـانيّ مـع كافـة الديانـات والمذاهـب المحيطـة ببلدنـا وشــرقنا مــن جهــة أخــرى
